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复旦大学杨芃原团队等建立精准N糖卵白质组学阐

发布时间:2017/11/30 00:00

  复旦大学化学系传授杨芃原团队、中科院计较手艺研究所研究员贺思敏团队、国度卵白质科学中间(上海)研究员黄超兰团队合作研究,建立了基于质谱的高通量糖基化肽段阐发方式pGlyco20,为精准N糖卵白质组学供给了新手艺飞行时间质谱仪。今天,相干研究功效以《pGlyco20:基于综合质控和一步质谱法的精准N糖卵白质组学糖肽阐发方式》为题颁发于《天然·通信》。

  据悉,杨芃原、贺思敏和黄超兰为配合通信作者。杨芃原为该文的Lead Co四级杆质谱仪ntact。

  糖基化是最液相色谱-质谱联用仪复杂的卵白后润色之一。与其他卵白后润色比拟,糖基化不单会发生宏不雅不均一性(每一个卵白上可能有多个后润色位点),更会发生海量的微不雅不均一性(每一个位点上可能有几十乃至上百种分歧的后润色基团)。另外,糖链自己的离子化效力很低。这些身分的连系使得糖基化阐发的通量和质量远低于卵白质组学的常规阐发程度。

  这项研究经由过程深切研究和测试质谱前提,开辟基于门路能量的一步质谱收集法,进步了糖肽判定的通量和开辟具有自立产权的pGlyco20糖肽检索引擎,从糖链、肽段、糖肽三个层面临糖肽数据库检索进行切确质控,从而大幅晋升了N糖卵白质组学阐发的通量和质量。

  同时,研究职员初次将重标元素利用于糖肽判定精确度阐发,为该范畴的质控阐发供给了新的方式及尺度。

  专家暗示,这项研究报导了今朝最大的糖基化数据集:在1%的假阳性率下,在小鼠的五个脏器种判定到了跨越一万条N糖肽。

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